2012年12月，市政府常务会通过泉州市科技奖评审，卫生系统有“细菌氨基糖苷类抗生素耐药性及耐药机制的系列研究”、“小儿肾小球疾病的综合研究”等12个项目通过市科技进步奖评审。据统计，2009-2012年，我市卫生系统获得62项省、市级科技进步奖，多项学科技术已达全国、全省的先进水平。科研带动医疗技术创新，促进了医疗技术水平的提升。目前，我市医疗单位已能成功开展试管婴儿、颅底外科微创、“四大脏器”移植等数十项诊疗新技术新项目。
近年来，市卫生局大力实施“科教兴医”战略，推进“百千万”人才工程，支持医疗卫生机构建设高水平医学研究和重点实验室，资助、鼓励和奖励学科带头人参加国家、省、市重大医学科研项目攻关。2012年，全市共有78个医学科研课题被纳入市卫生局资助项目，并开展了69项市级继续医学教育项目。目前我市拥有三级医院10家，总数居全省设区市前列，所有县市综合性医院均达到二级甲等医院及以上水平，已成功开展“四大脏器”的移植手术，多项学科技术已达到全国、全省的先进水平：2012年，泉州市首例试管婴儿在市妇幼保健院成功诞生，之后陆续有三例四个（其中一例为“龙凤胎”）试管婴儿降生，成功率超过国内平均水平；市第一医院耳鼻喉科成功开展了我省首例经鼻内镜颅底肿瘤切除术，开创颅底外科微创手术的先河；福医大附二院肝胆外科采用腹腔镜下切除肝表面结节及射频治疗肝实质结节并联合保肛的经腹直肠癌切除术，三种方法联合一次性治疗直肠癌并肝转移病例；正骨医院采用椎间孔镜技术治疗脊柱外科疾病……这些新技术、新项目的开展给久治不愈的患者带来福音，使“咱厝人”不出泉州就能接受到优质的医疗服务。